人体如果缺镁会导致多种不良症状发生，比如缺乏镁会干扰神经冲动传导至肌肉，引起暴躁及紧张。饮食中补充镁能帮助预防忧郁、头晕、肌肉衰竭、肌肉抽痛、心脏疾病、血压高，并维持体内适当的酸碱质。此必需矿物质保护动脉管壁免于受血压突然改变所引起的压迫，并在骨骼形成及醣类和矿物质代谢等方面，扮演一个角色。在有维他命B6的情况下，镁能帮忙减少并溶解磷酸钙形成。
缺镁会使肌肉细胞处在一种过度紧张无法放松的状态，而容易有虚弱疲劳、肌肉痉挛、呕吐等现象。镁也是骨骼组织中重要的成份，并和热量的新陈代谢与蛋白质的合成有关。镁与心脏的健康关系也很密切，缺镁使心脏跳动不规则。
具体来说，缺镁会导致如下一些症状——
迷惑和不省人事；慢性酒精中毒；抽搐；肝硬化；躁动不安；吸收不良症候群；神经质；口炎性腹泻；皮肤问题；红孩病；软组织之硬化；严重的呕吐；肌肉收缩；糖尿病人发生低血镁症。
尤以女性常常缺镁，偏偏镁对她们特别重要。更年期后的妇女尤其容易镁含量不足，因此常常发生血液不当凝结、导致心脏病发作及中风。除了增加女性心脏病的罹患率之外，镁含量偏低还会引起另一项重大的健康毛病：骨质疏松症。
孕妇若缺镁，易得毒血症（一种危害到母体及婴儿的高血压）导致早产。此外，缺镁也可能是经前症候群（PMS）的因素之一。
人体能迅速调节体内镁的含量，通常一天镁的摄取量超过2克时，多余的镁便会被排泄掉，如果从饮食中摄取的镁较少，小肠会全部吸引，而肾把它储存起来。许多食物都含有镁，只要日常饮食均衡，就能满足人体对镁的需求。
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